Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms