Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCMF1Q9P0J7 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms