Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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RDH8Q9NYR8 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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RDH8Q9NYR8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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