Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms