Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms