Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms