Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP58

ABCB6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB6Q9NP58 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCB6Q9NP58 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCB6Q9NP58 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCB6Q9NP58 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCB6Q9NP58 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCB6Q9NP58 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCB6Q9NP58 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCB6Q9NP58 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCB6Q9NP58 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCB6Q9NP58 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms