Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms