Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NYXQ9GZU5 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms