Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1EQ9GZS1 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms