Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZM3

GSX2, GS homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSX2Q9BZM3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GSX2Q9BZM3 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GSX2Q9BZM3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GSX2Q9BZM3 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GSX2Q9BZM3 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GSX2Q9BZM3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GSX2Q9BZM3 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GSX2Q9BZM3 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GSX2Q9BZM3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms