Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms