Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SALL3Q9BXA9 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms