Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms