Protein–RNA interactions for Protein: Q99674

CGREF1, Cell growth regulator with EF hand domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGREF1Q99674 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms