Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORT1Q99523 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms