Protein–RNA interactions for Protein: Q96ME1

FBXL18, F-box/LRR-repeat protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL18Q96ME1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FBXL18Q96ME1 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FBXL18Q96ME1 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXL18Q96ME1 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms