Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms