Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms