Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms