Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms