Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms