Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms