Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms