Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms