Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms