Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
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