Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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SYT9Q86SS6 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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SYT9Q86SS6 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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SYT9Q86SS6 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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SYT9Q86SS6 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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SYT9Q86SS6 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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