Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP31Q70CQ4 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
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