Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2H8

TMEM53, Transmembrane protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM53Q6P2H8 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM53Q6P2H8 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms