Protein–RNA interactions for Protein: Q6EMB2

TTLL5, Tubulin polyglutamylase TTLL5, humanhuman

Predictions only

Length 1,281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL5Q6EMB2 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TTLL5Q6EMB2 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TTLL5Q6EMB2 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TTLL5Q6EMB2 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTLL5Q6EMB2 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTLL5Q6EMB2 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTLL5Q6EMB2 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTLL5Q6EMB2 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTLL5Q6EMB2 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTLL5Q6EMB2 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTLL5Q6EMB2 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTLL5Q6EMB2 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTLL5Q6EMB2 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTLL5Q6EMB2 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTLL5Q6EMB2 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTLL5Q6EMB2 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTLL5Q6EMB2 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTLL5Q6EMB2 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTLL5Q6EMB2 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTLL5Q6EMB2 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTLL5Q6EMB2 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTLL5Q6EMB2 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TTLL5Q6EMB2 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTLL5Q6EMB2 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTLL5Q6EMB2 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTLL5Q6EMB2 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTLL5Q6EMB2 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTLL5Q6EMB2 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTLL5Q6EMB2 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTLL5Q6EMB2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTLL5Q6EMB2 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTLL5Q6EMB2 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTLL5Q6EMB2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTLL5Q6EMB2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTLL5Q6EMB2 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTLL5Q6EMB2 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTLL5Q6EMB2 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTLL5Q6EMB2 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTLL5Q6EMB2 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTLL5Q6EMB2 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTLL5Q6EMB2 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTLL5Q6EMB2 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTLL5Q6EMB2 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTLL5Q6EMB2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTLL5Q6EMB2 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTLL5Q6EMB2 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTLL5Q6EMB2 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTLL5Q6EMB2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTLL5Q6EMB2 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTLL5Q6EMB2 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTLL5Q6EMB2 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTLL5Q6EMB2 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTLL5Q6EMB2 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTLL5Q6EMB2 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTLL5Q6EMB2 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTLL5Q6EMB2 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTLL5Q6EMB2 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTLL5Q6EMB2 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTLL5Q6EMB2 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTLL5Q6EMB2 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
TTLL5Q6EMB2 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TTLL5Q6EMB2 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TTLL5Q6EMB2 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TTLL5Q6EMB2 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TTLL5Q6EMB2 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TTLL5Q6EMB2 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TTLL5Q6EMB2 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TTLL5Q6EMB2 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TTLL5Q6EMB2 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL5Q6EMB2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL5Q6EMB2 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL5Q6EMB2 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL5Q6EMB2 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL5Q6EMB2 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL5Q6EMB2 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL5Q6EMB2 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL5Q6EMB2 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL5Q6EMB2 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL5Q6EMB2 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL5Q6EMB2 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL5Q6EMB2 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL5Q6EMB2 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL5Q6EMB2 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL5Q6EMB2 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL5Q6EMB2 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL5Q6EMB2 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL5Q6EMB2 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL5Q6EMB2 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL5Q6EMB2 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL5Q6EMB2 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL5Q6EMB2 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL5Q6EMB2 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL5Q6EMB2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL5Q6EMB2 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL5Q6EMB2 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL5Q6EMB2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL5Q6EMB2 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL5Q6EMB2 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL5Q6EMB2 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL5Q6EMB2 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms