Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms