Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CEP170Q5SW79 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CEP170Q5SW79 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms