Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms