Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms