Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7I2

CNPY1, Protein canopy homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY1Q3B7I2 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNPY1Q3B7I2 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNPY1Q3B7I2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms