Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FHOD3Q2V2M9 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FHOD3Q2V2M9 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FHOD3Q2V2M9 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FHOD3Q2V2M9 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FHOD3Q2V2M9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FHOD3Q2V2M9 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
FHOD3Q2V2M9 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FHOD3Q2V2M9 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FHOD3Q2V2M9 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FHOD3Q2V2M9 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FHOD3Q2V2M9 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FHOD3Q2V2M9 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FHOD3Q2V2M9 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FHOD3Q2V2M9 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FHOD3Q2V2M9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FHOD3Q2V2M9 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FHOD3Q2V2M9 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FHOD3Q2V2M9 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
FHOD3Q2V2M9 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
FHOD3Q2V2M9 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FHOD3Q2V2M9 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FHOD3Q2V2M9 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FHOD3Q2V2M9 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms