Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms