Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PTPRNQ16849 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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PTPRNQ16849 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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PTPRNQ16849 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
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PTPRNQ16849 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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