Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CA9Q16790 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CA9Q16790 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CA9Q16790 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CA9Q16790 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CA9Q16790 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CA9Q16790 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CA9Q16790 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CA9Q16790 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CA9Q16790 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CA9Q16790 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CA9Q16790 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CA9Q16790 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CA9Q16790 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CA9Q16790 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CA9Q16790 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CA9Q16790 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CA9Q16790 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CA9Q16790 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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CA9Q16790 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CA9Q16790 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CA9Q16790 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CA9Q16790 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CA9Q16790 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CA9Q16790 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CA9Q16790 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CA9Q16790 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CA9Q16790 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CA9Q16790 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CA9Q16790 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CA9Q16790 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CA9Q16790 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CA9Q16790 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CA9Q16790 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CA9Q16790 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CA9Q16790 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CA9Q16790 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CA9Q16790 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CA9Q16790 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CA9Q16790 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CA9Q16790 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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CA9Q16790 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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CA9Q16790 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CA9Q16790 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CA9Q16790 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CA9Q16790 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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CA9Q16790 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CA9Q16790 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CA9Q16790 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CA9Q16790 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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CA9Q16790 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CA9Q16790 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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CA9Q16790 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CA9Q16790 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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CA9Q16790 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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CA9Q16790 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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CA9Q16790 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CA9Q16790 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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CA9Q16790 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CA9Q16790 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CA9Q16790 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CA9Q16790 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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CA9Q16790 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CA9Q16790 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CA9Q16790 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CA9Q16790 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CA9Q16790 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CA9Q16790 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CA9Q16790 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CA9Q16790 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CA9Q16790 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CA9Q16790 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CA9Q16790 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CA9Q16790 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CA9Q16790 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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