Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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