Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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