Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms