Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCF4Q15080 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCF4Q15080 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCF4Q15080 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCF4Q15080 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCF4Q15080 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCF4Q15080 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCF4Q15080 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCF4Q15080 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCF4Q15080 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCF4Q15080 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCF4Q15080 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCF4Q15080 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCF4Q15080 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NCF4Q15080 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NCF4Q15080 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NCF4Q15080 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCF4Q15080 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCF4Q15080 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NCF4Q15080 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCF4Q15080 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCF4Q15080 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCF4Q15080 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCF4Q15080 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCF4Q15080 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCF4Q15080 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCF4Q15080 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCF4Q15080 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCF4Q15080 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCF4Q15080 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCF4Q15080 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCF4Q15080 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCF4Q15080 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCF4Q15080 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCF4Q15080 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCF4Q15080 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCF4Q15080 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCF4Q15080 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCF4Q15080 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCF4Q15080 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCF4Q15080 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCF4Q15080 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCF4Q15080 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCF4Q15080 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCF4Q15080 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCF4Q15080 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCF4Q15080 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCF4Q15080 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCF4Q15080 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCF4Q15080 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCF4Q15080 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCF4Q15080 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCF4Q15080 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCF4Q15080 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCF4Q15080 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCF4Q15080 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCF4Q15080 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCF4Q15080 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCF4Q15080 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCF4Q15080 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCF4Q15080 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCF4Q15080 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCF4Q15080 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms