Protein–RNA interactions for Protein: Q15027

ACAP1, Arf-GAP with coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAP1Q15027 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACAP1Q15027 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACAP1Q15027 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACAP1Q15027 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACAP1Q15027 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACAP1Q15027 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACAP1Q15027 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACAP1Q15027 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACAP1Q15027 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACAP1Q15027 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACAP1Q15027 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACAP1Q15027 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACAP1Q15027 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACAP1Q15027 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACAP1Q15027 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACAP1Q15027 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACAP1Q15027 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACAP1Q15027 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACAP1Q15027 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACAP1Q15027 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACAP1Q15027 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACAP1Q15027 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
ACAP1Q15027 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACAP1Q15027 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACAP1Q15027 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACAP1Q15027 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACAP1Q15027 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACAP1Q15027 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACAP1Q15027 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACAP1Q15027 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACAP1Q15027 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACAP1Q15027 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACAP1Q15027 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
ACAP1Q15027 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACAP1Q15027 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACAP1Q15027 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms