Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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RAB39AQ14964 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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RAB39AQ14964 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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RAB39AQ14964 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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RAB39AQ14964 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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RAB39AQ14964 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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