Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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