Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms