Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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ITGB3BPQ13352 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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ITGB3BPQ13352 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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ITGB3BPQ13352 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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ITGB3BPQ13352 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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ITGB3BPQ13352 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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ITGB3BPQ13352 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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ITGB3BPQ13352 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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ITGB3BPQ13352 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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ITGB3BPQ13352 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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ITGB3BPQ13352 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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ITGB3BPQ13352 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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ITGB3BPQ13352 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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