Protein–RNA interactions for Protein: Q13285

NR5A1, Steroidogenic factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR5A1Q13285 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR5A1Q13285 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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