Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME3Q13232 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME3Q13232 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME3Q13232 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME3Q13232 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME3Q13232 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME3Q13232 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME3Q13232 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME3Q13232 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME3Q13232 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME3Q13232 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME3Q13232 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME3Q13232 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NME3Q13232 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME3Q13232 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME3Q13232 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME3Q13232 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME3Q13232 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME3Q13232 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME3Q13232 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME3Q13232 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME3Q13232 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME3Q13232 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NME3Q13232 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME3Q13232 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME3Q13232 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME3Q13232 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME3Q13232 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME3Q13232 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME3Q13232 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NME3Q13232 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME3Q13232 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NME3Q13232 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME3Q13232 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME3Q13232 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME3Q13232 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME3Q13232 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME3Q13232 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME3Q13232 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME3Q13232 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME3Q13232 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME3Q13232 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME3Q13232 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME3Q13232 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME3Q13232 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME3Q13232 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME3Q13232 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME3Q13232 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NME3Q13232 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME3Q13232 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME3Q13232 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NME3Q13232 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME3Q13232 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME3Q13232 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME3Q13232 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME3Q13232 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME3Q13232 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME3Q13232 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME3Q13232 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME3Q13232 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME3Q13232 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME3Q13232 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME3Q13232 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME3Q13232 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME3Q13232 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME3Q13232 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME3Q13232 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME3Q13232 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME3Q13232 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME3Q13232 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME3Q13232 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME3Q13232 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME3Q13232 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NME3Q13232 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME3Q13232 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME3Q13232 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NME3Q13232 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME3Q13232 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME3Q13232 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME3Q13232 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME3Q13232 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME3Q13232 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME3Q13232 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NME3Q13232 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NME3Q13232 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME3Q13232 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME3Q13232 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME3Q13232 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME3Q13232 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME3Q13232 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME3Q13232 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NME3Q13232 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME3Q13232 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME3Q13232 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME3Q13232 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME3Q13232 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME3Q13232 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME3Q13232 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NME3Q13232 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME3Q13232 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
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